Данный орган был создан в 2014 году и действовал под управлением Национального банка РК. В 2020 году его функции передали Высшей аудиторской палате (ВАП).

Сейчас, в соответствии с поручениями пПрезидента страны, Комиссия возобновляет деятельность в обновлённом составе и формате. Очередное заседание состоялось 21 февраля в Высшей аудиторской палате под председательством Алихана Смаилова.

На встрече присутствовали представители администрации президента, НБК, генеральной прокуратуры, агентства по противодействию коррупции, агентства по финансовому мониторингу, комитета национальной безопасности, а также министерств финансов и национальной экономики, депутаты сената и мажилиса.

Президент Касым-Жомарт Токаев в своём сентябрьском Послании народу Казахстана особо отметил значимость Нацфонда.

"Средства Нацфонда в первую очередь должны служить интересам нашего государства и использоваться для достижения стратегических целей, а не обслуживать зарубежные финансовые институты. Нацфонд выступает важнейшим инструментом обеспечения долгосрочной макроэкономической стабильности, поэтому требуется эффективное управление им", — подчеркнул он.

Алихан Смаилов заявил, что методы контроля за расходованием средств фонда будут пересмотрены и обновлены.

"Нам необходимо перезапустить работу Комиссии. Качественно консолидировать межведомственные компетенции и чётко определить зоны ответственности за контроль над эффективным и целевым использованием средств Нацфонда", — заявил он.

Смаилов отметил, что общественный интерес к рациональному расходованию фонда значительно вырос, особенно после запуска президентской программы " Национальный фонд – детям".

"Осуществляемые трансферты из Нацфонда должны обеспечивать экономический возврат. Эти средства не могут расходоваться на незначимые цели. Такую задачу поставил Глава государства", — добавил председатель ВАП.

Среди основных направлений работы Комиссии на предстоящий период:

• Проверка средств, выделенных на поддержку экономики на льготных условиях.
• Разработка предложений по перераспределению средств Нацфонда на приоритетные направления или их возврату.

Также обсуждались вопросы обновления состава Комиссии, регламентации её деятельности, а также повышения качества аналитических заключений.